MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-4

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015917	A	6	6	1317	1322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015917	AT	3	6	1351	1356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015917	AT	3	6	1371	1376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015917	A	7	7	1380	1386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015917	TTAA	2	8	1395	1402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015917	TTA	2	6	1477	1482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015917	TTA	2	6	1517	1522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015917	A	7	7	1557	1563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015917	ATT	2	6	1614	1619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015917	TTTA	2	8	1624	1631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015917	T	8	8	1831	1838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015917	AT	3	6	1852	1857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015917	TCC	2	6	1858	1863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015917	CTA	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015917	AT	4	8	1901	1908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015917	A	8	8	1921	1928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015917	AAT	2	6	2886	2891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015917	ATT	2	6	2911	2916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015917	A	6	6	2918	2923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015917	TGAT	2	8	2941	2948	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015917	TGT	2	6	2988	2993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015917	A	6	6	3128	3133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015917	A	7	7	3141	3147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015917	AT	3	6	3162	3167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015917	T	8	8	3195	3202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015917	ATA	2	6	3258	3263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015917	ATT	2	6	3327	3332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015917	TTAAA	2	10	3333	3342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015917	T	8	8	3381	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015917	TGA	2	6	3404	3409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015917	ATT	2	6	3642	3647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015917	AAT	2	6	3699	3704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015917	TTA	2	6	3739	3744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015917	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015917	ATTT	2	8	3803	3810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015917	AACT	2	8	3812	3819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_015917	TAT	2	6	3830	3835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015917	CTA	2	6	3863	3868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015917	TAA	2	6	3875	3880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015917	A	6	6	4065	4070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015917	GCAAAG	2	12	4996	5007	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_015917	ATTTA	2	10	5056	5065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015917	AATAT	2	10	5066	5075	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015917	ATA	2	6	5113	5118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015917	T	7	7	5136	5142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015917	AGAAA	2	10	5150	5159	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015917	TTA	2	6	5160	5165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015917	AAGC	2	8	5207	5214	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015917	TTA	2	6	5222	5227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015917	TGT	2	6	5281	5286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015917	TAA	2	6	5365	5370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015917	ATT	2	6	6235	6240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015917	TAA	2	6	6241	6246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015917	CAATAA	2	12	6251	6262	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_015917	TTAA	2	8	6277	6284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015917	T	6	6	6294	6299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015917	AGA	2	6	6564	6569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015917	AAG	2	6	6620	6625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015917	TTAA	2	8	6665	6672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015917	AAG	2	6	6702	6707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015917	CATT	2	8	6735	6742	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015917	A	7	7	6756	6762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015917	AG	3	6	6801	6806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015917	AGT	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015917	GATT	2	8	6821	6828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015917	AAAG	2	8	6913	6920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015917	AGA	2	6	6936	6941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015917	TA	3	6	6964	6969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015917	ATA	2	6	7010	7015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015917	TAA	3	9	7083	7091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015917	T	6	6	7133	7138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015917	T	6	6	7159	7164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015917	TTTA	2	8	7182	7189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015917	AAT	2	6	7212	7217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015917	CAA	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015917	TAC	2	6	7252	7257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015917	TAAAT	2	10	7305	7314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015917	T	7	7	7322	7328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015917	AAT	2	6	7337	7342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015917	GAA	2	6	7357	7362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015917	TTA	2	6	7379	7384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015917	TCAT	2	8	7403	7410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015917	TG	3	6	7417	7422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015917	ATT	2	6	7438	7443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015917	TAA	2	6	7455	7460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015917	T	6	6	7478	7483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015917	T	8	8	7493	7500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015917	T	6	6	7546	7551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015917	T	6	6	7585	7590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015917	T	6	6	7855	7860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015917	TTTTA	2	10	7872	7881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015917	ATT	2	6	8014	8019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015917	TCA	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015917	TA	3	6	8099	8104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015917	T	7	7	8108	8114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015917	TGT	2	6	8138	8143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015917	TGG	2	6	8147	8152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015917	GAT	2	6	8214	8219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015917	TTTA	2	8	8256	8263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015917	TAA	2	6	8268	8273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015917	A	7	7	8302	8308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015917	ATT	2	6	8368	8373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015917	TAA	2	6	8377	8382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015917	ATT	2	6	8458	8463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015917	GTT	2	6	8464	8469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015917	ATTTT	2	10	8474	8483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015917	AATA	2	8	8493	8500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015917	A	7	7	8500	8506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015917	T	6	6	8511	8516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015917	ATT	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015917	TAT	2	6	8624	8629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015917	TAA	2	6	8632	8637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015917	ATT	3	9	8694	8702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015917	TTATT	2	10	8786	8795	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015917	TG	3	6	8824	8829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015917	TA	3	6	8840	8845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015917	GCT	2	6	8856	8861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015917	AT	3	6	8898	8903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015917	A	7	7	8915	8921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015917	ATA	2	6	8949	8954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015917	ATT	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015917	AT	3	6	9042	9047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015917	T	8	8	9070	9077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015917	ATCATA	2	12	9100	9111	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_015917	A	7	7	9147	9153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015917	TAA	2	6	9157	9162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015917	ATT	2	6	9164	9169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015917	ATT	2	6	9191	9196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015917	T	7	7	9219	9225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015917	TTTA	2	8	9235	9242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015917	AGA	2	6	9345	9350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015917	TAT	2	6	9377	9382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015917	TTA	2	6	9399	9404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015917	TAA	2	6	9412	9417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015917	TA	3	6	9435	9440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015917	TAA	2	6	9488	9493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015917	T	6	6	9503	9508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015917	TTA	2	6	9645	9650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015917	T	6	6	9658	9663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015917	TAT	2	6	9674	9679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015917	ATA	2	6	9700	9705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015917	A	7	7	9715	9721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015917	TA	3	6	9722	9727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015917	AAG	2	6	9751	9756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015917	AT	3	6	9758	9763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015917	AAC	2	6	9766	9771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015917	AAGA	2	8	9846	9853	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015917	TAA	2	6	9869	9874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015917	A	7	7	9943	9949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015917	TAT	3	9	9954	9962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015917	AT	4	8	9964	9971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015917	AAT	2	6	9972	9977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015917	AAGC	2	8	9978	9985	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_015917	AAT	2	6	10001	10006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015917	AAAG	2	8	10029	10036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015917	TAT	2	6	10140	10145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_015917	TTA	2	6	10313	10318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_015917	TA	3	6	14246	14251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_015917	T	7	7	19559	19565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_015917	ATTT	2	8	19619	19626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_015917	A	6	6	19697	19702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_015917	AT	3	6	19709	19714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_015917	TGT	2	6	19717	19722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015917	ATT	4	12	19740	19751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015917	TGA	2	6	19788	19793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_015917	AATT	2	8	19847	19854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.